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辨之伪书，有九十一种。全书的编次分类和考辨方法，有不少缺失。梁启超中国近三百年学术史曾批评说：「体例凌杂，篇帙亦太简单，未能尽其辞，所断亦不必尽当。」(页二五三)虽然如此，姚氏这部书对清末以来的学术发展仍有不少影响。因此，传刻的板本即有二十余种，为其考释、补证者，也有数家。兹先将传刻之板本胪列如下：
1.清嘉庆间，歙西鲍廷博刻知不足斋丛书本。
2.清光绪三年，广汉张馥笙成都刻本，为受经堂丛书之一。
3.清光绪三年，苏州文学山房活字印本，又日本东京大学东洋文化研究所藏有清光绪三年，跋活字印本。
4.清光绪七年，归安姚氏粤东藩署校刊，覆知不足斋本，为晋石厂丛书十种之一；又民国二十三年，海虞瞿氏铁琴铜剑楼重修本。
5.清光绪八年，肄水卢氏芸林仙馆补刻清嘉庆间歙西鲍廷博知不足斋丛书本。
6.清光绪十五年，长沙章恭斌经济书堂校刊本。
7.清光绪十八年浙江书局刻本。
8.清光绪二十年，广州雅雨堂刊本。
9.民国十年，上海古书流通处影印嘉庆年间鲍氏知不足斋丛书本。
10.民国十二年，沔阳卢靖据浙江局本刊刻，为慎始基斋丛书十二种之一。
11.民国十三年，吴县江杏溪辑印苏州文学山房本，为江氏聚珍版丛书初集之一。
12.民国十八年，北平朴社排印本，为辨伪丛刊之一，又二十二年有再版本。
13.民国二十四年上海商务印书馆，覆知不足斋丛书本，收入丛书集成初编总类中。
14.民国间，苏州振粤书社铅印本。
15.一九五五年，北京中华书局排印本，收入古籍考辨丛刊第一集中。
16.民国五十年，台北世界书局影印本，收入中国学术名著第二辑，中国目录学名著第一集，伪书考五种内。
17.民国五十一年，香港太平书局影印民国十八年朴社排印本。
18.民国五十六年，台北台湾商务印书馆景排印本，为国学基本丛书四百种之一。
19.民国五十七年，台北华联出版社印行。
20.民国五十八年，台北台湾开明书店印行，为开明辨伪丛刊之一。
21.民国七十四年，台北新文丰出版公司据知不足斋丛书本影印，收入丛书集成新编第四册。
日本方面有：
22.日本文政五年(一八二二)官版刊本。
23.江户昌平？学问所刊本。
此外，为古今伪书考作考释、补证的，有下列数家：
(一)古今伪书考考释 金受申
民国十三年，北平中华印刷局排印本。
(二)重考古今伪书考 顾实
民国十五年，上海大东书局排印本。民国十七年再版本。
(三)古今伪书考书后 程大璋
1.民国年间刊，邬庆时辑半帆楼丛书中
2.民国年间刊，邬庆时辑白坚堂丛书第一集中。
(四)古今伪书考补证 黄云眉
1.民国二十一年，金陵大学中国文化研究所铅印本。又一九六四年重印本。
2.一九五九年，山东人民出版社排印本。又一九六四年重印本。
3.民国六十一年，台北文海出版社据金陵大学中国文化研究所排印本影印。
4.一九八○年，山东齐鲁书社据山东人民出版社一九六四年本重排印。
由于考释、补证的材料相当多，且如金受申和顾实的书，坊间皆已绝版。为使读者读姚氏书时，能很容易参考到这些数据，乃将所能找到的金受申、顾实、黄云眉之书，按姚氏书考辨各伪书之顺序，分别系入。兹将所据之版本胪列如下：
1.古今伪书考，顾颉刚点校 古籍考辨丛刊本 一九五五年北京中华书局排印本。
2.古今伪书考考释 民国十三年北平中华印刷局排印本。
3.重考古今伪书考 民国十五年上海大东书局排印本。
4.古今伪书考补证 一九八○年山东齐鲁书社排印本。
汇集时，为使读者便于覆按，于考释等三书各条末，皆标注原书之页数。由于本书为汇集各家考辨文字而成，可说是古今伪书考的集大成，非根据某书排印或点校，故除姚氏之原序外，各家之序跋，皆列入附录中。
搜集有关古今伪书考补正资料时，承南京大学中文系张宏生教授，在该校图书馆寻得顾实重考古今伪书考，并代为借印。本书之汇集工作始能顺利完成。
汇集工作，由东吴大学中国文学研究所硕士生童小铃负责，谨致谢忱。
古今伪书考序
姚际恒
造伪书者，古今代出其人，故伪书滋多于世。学者于此，真伪莫辨，而尚可谓之读书乎！是必取而明辨之，此读书第一义也。予辄不自量，以世所传伪书，分经史子三类，考证于后。明宋景濂有诸子辨；予合经史子而辨之。凡今世不传者，与夫琐细无多者，皆不录焉。其有前人辨论精确者，悉载于前，以见非予之私说云。四部